Muzeum Twierdzy Kostrzyn realizowało zadania finansowe zgodnie z zatwierdzonym planem wydatków na rok 2012. Otrzymaną dotację z budżetu Miasta oraz wypracowane dochody własne wykorzystano na działalność muzeum.
 

I. Przedsięwzięcia organizacyjne:
1. Wprowadzenie zmiany w systemie pracy Muzeum (wraz z punktem informacyjnym w Bramie Berlińskiej) mające na celu lepsze funkcjonowanie placówki w kontekście zadań edukacyjnych i udostępniania dóbr kultury.
2. Opracowanie i wdrożenie do realizacji "Wieloletniego programu badań archeologicznych na terenie Starego Miasta w Kostrzynie nad Odrą".
3. Zmodyfikowanie zakresu obowiązków poszczególnych pracowników i przystosowanie ich do potrzeb Muzeum.
4. Organizacja spotkania nowo powołanej Rady Muzeum, na którym przyjęto Regulamin pracy Rady oraz wybrano Przewodniczącego.
5. Wypowiedzenie umowę dzierżawy Bramy Chyżańskiej nierzetelnemu kontrahentowi.
6. Utworzenie zespołu wolontariuszy i eksploratorów przy Muzeum Twierdzy.
 

II. Ważniejsze osiągnięcia i wydarzenia:
1. Rozpoczęcie badań archeologicznych przy zamku, odkrycie fragmentów zamku krzyżackiego, odkrycie i eksploracja tunelu.
2. Ustawienie na dziedzińcu zamku odnalezionego cokołu pomnika Wielkiego Elektora.
3. Przeprowadzenie badań powierzchniowych terenu cmentarza żołnierzy radzieckich w lesie za Os. Leśnym, następnie współudział w ekshumacji poległych.
4. Kontynuacja współpracy ze Stowarzyszeniem Perkun z Poznania, inwentaryzacja piwnic staromiejskich kamienic – nakręcenie filmu o kostrzyńskich podziemiach oraz współpraca z redakcją czasopisma „Odkrywca” – publikacja na łamach miesięcznika serii artykułów o twierdzy Kostrzyn.
5. Przeprowadzenie badań pomiarowych kompleksu bunkra ćwiczebnego położonego w lesie przy szosie szczecińskiej.
6. Czynienie starań o pozyskanie wozu tramwajowego – wizyta w MPK we Wrocławiu.
7. Ustawienie tablicy reklamowej na drodze dojazdowej od strony Niemiec oraz wykonanie we własnym zakresie testowej tablicy informacyjnej ustawionej przed zamkiem; przygotowanie projektów kolejnych tablic.
8. Kontynuacja akcji zbierania eksponatów na potrzeby planowanej stałej ekspozycji muzealnej.
9. Umieszczenie reklamy, zachęcającej do zwiedzenia Twierdzy Kostrzyn na telebimie LED w okolicach bazaru.
10. Przeprowadzenie kwerendy i sprowadzenie reprodukcji archiwaliów na potrzeby stałej ekspozycji; pozyskanie dokumentacji do budowy uzupełniających ją makiet i modeli.
11. Praca nad przygotowaniem ekspozycji muzealnej w Bastionie Filip oraz specyfikacji przetargowej na wykonanie wystawy.
12. Bieżące konsultowanie projektów renowacyjnych prowadzonych i planowanych na Starym Mieście oraz nadzór archeologiczny nad wspomnianymi projektami.
13. Zakup systemu do oprowadzania wycieczek tour-guide.
14. Przeprowadzenie we współpracy z grupą kostrzyńskich wolontariuszy i eksploratorów rozpoznawczych powierzchniowych badań archeologicznych na terenie Szumiłowa.
15. Nawiązanie współpracy z:
- organizacją Pomost,
- naczelnym rabinem RP,
- organizacją Witeź,
- Muzeum Chwały Oręża Polskiego w Witnicy,
- Verein für die Geschichte Küstrins (Küstrin-Kietz),
- Departamentem Obrony USA (poszukiwanie zaginionych żołnierzy)
16. Podpisanie umów na wspólne przedsięwzięcia i projekty z :
- Przedszkolem Miejskim nr 2,
- Stowarzyszeniem Kulturland Brandenburg,
- Firmą „Haus der Brandenburgisch-Preußischen Geschichte GmbH“ (Dom Historii brandenbursko-pruskiej),
- Urzędem Miasta Kostrzyn.
17. Obsługa ruchu turystycznego na Starym Mieście (kilkadziesiąt grup wycieczkowych).
18. Lekcje muzealne dla dzieci i młodzieży (5).
 

III. Imprezy i wydarzenia zorganizowane (współorganizowane) przez MTK
1. Prelekcja z okazji trzechsetnej rocznicy urodzin Fryderyka II, połączona z prezentacją filmu "Za wszelką cenę" oraz spacerem po Starym Mieście.

2. Cykl wykładów dotyczących historii Starego Miasta przy współpracy z Kostrzyńskim Centrum Kultury. Wykłady prowadzili pracownicy Muzeum oraz zaproszeni prelegenci z kraju i zagranicy. Wykłady rozpoczęły się 1 marca. Łącznie odbyło się 9 spotkań.
3. Ogłoszenie i rozstrzygnięcie konkursu na opracowanie koncepcji plastycznej miejsca upamiętniającego ścięcie Hansa Hermanna von Katte na Starym Mieście – „Dzień z Hermannem von Katte”
4. Organizacja wystawy „Memento Kostrzyn – Fryderyk 300.”
5. Prezentacja wystawy IPN „Ruch Młodzieży Niezależnej w Gorzowie”
6. Spotkanie kolekcjonerów kostrzyńskich
7. Piknik eksploratorów
8. XIII Dni Twierdzy Kostrzyn z seminarium historycznym
9. Akcja wejścia i eksploracji tunelu odkrytego podczas badań archeologicznych
10. Międzynarodowa konferencja we współpracy z Gedenkstätte Seelower Höhen „II Wojna Światowa i jej skutki”
11. Warsztaty topograficzno-historyczne w ramach projektu "Polsko-Niemieckie Spotkanie Młodzieży w Kostrzynie nad Odrą".
12. Odsłonięcie pamiątkowej tablicy przy dawnej bramie wjazdowej do koszar przy ul. Wyszyńskiego upamiętniającej miejsce stacjonowania wojsk na tym terenie.
13. Publikacja i prezentacja książki Ralfa Juona "Kostrzyn 1232-1932".
14. Ustanowienie tytułu „Przyjaciel Muzeum Twierdzy”. Tytułem tym zostali uhonorowani w 2012 roku panowie Ireneusz Nalewajczyk, Józef Piątkowski i Klaus Thiel.
 

IV. Aktywność na zewnątrz
Muzeum bierze udział w różnych spotkaniach mających na celu promowanie Starego Miasta, również poprzez rozdawanie ulotek, sprzedaż książek, pamiątek dot. Starego Miasta. Przedstawiciele Muzeum brali udział m.in. w:
- Forum Stowarzyszenia Podziemne Trasy Turystyczne Polski w Kłodawie,
- targach turystycznych ITB w Berlinie, w Szczecinie i we Frankfurcie n.O.
- spotkaniu partnerskim w Peitz,
- rocznicy wyzwolenia obozu koncentracyjnego w Słońsku,
- sesji historycznej w Ośnie Lubuskim – Colloquia Lubuskie (2 wystąpienia)
- konferencji archeologicznej w Janowcu k. Świebodzina (1 wystąpienie),
- seminarium doktoranckim prof. Mączyńskiej w Łodzi (1 wystąpienie),
- spotkaniu sprawozdawczym Stowarzyszenia Historii Kostrzyna w Küstrin-Kietz, (1 wystąpienie),
- IV Srebrnogórskiej Konferencji Historycznej (1 wystąpienie),
- Międzynarodowej Konferencji Naukowej "Fortyfikacje nowożytne w Polsce – badanie, realizacje, projekty" w Toruniu (1 wystąpienie),
- spotkaniu dot. turystyki organizowanym w Witnicy przez Urząd Marszałkowski,
- międzyszkolnym konkursie wiedzy o historii Kostrzyna,
- jubileuszu Zespołu Szkół w Kostrzynie,
- otwarciu placu zabaw przy Przedszkolu nr 1,
- spotkaniu z Bogusławem Wołoszańskim,
- wycieczce do Niemiec i konferencji organizowanej przez Starostwo Powiatowe w Gorzowie w sprawie drogi rowerowej wzdłuż Warty (2 spotkania),
- Dniu Sybiraka i Marszu Żywej Pamięci w Kostrzynie,
- odbiorze technicznym inwestycji związanej z rewitalizacją Bastionu Filip i Brandenburgia,
- spotkaniu inauguracyjnym projektu "Forte Cultura",
- międzynarodowej konferencji dotyczącej turystyki w Słubicach,
- programach i audycjach telewizyjnych.
Ponadto pracownicy Muzeum złożyli robocze wizyty w Peitz, w Muzeum w Gorzowie, Muzeum – miejscu pamięci w Seelow, Muzeum w Międzyrzeczu, Muzeum Chwały Oręża Polskiego w Witnicy, Tajnym Archiwum Państwowym w Berlinie oraz odbyli szkolenia BHP oraz w zakresie prawa pracy i finansów.